關(guān)于WIPO ST.26 序列表制作的一些tips ?

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“國(guó)知局于2022年6月10日發(fā)布第四五八號(hào)公告，宣布從2022年7月1日起，向國(guó)知局提交的國(guó)家專利申請(qǐng)和PCT國(guó)際申請(qǐng)，包含于序列表的，該序列表電子文件應(yīng)符合WIPO ST.26標(biāo)準(zhǔn)要求?！?/strong>

來源：IPRdaily中文網(wǎng)（iprdaily.cn）

作者：鄧旭 北京派特恩知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司

一、ST.26的背景

1998年11月，WIPO出臺(tái)了《專利申請(qǐng)中核苷酸和氨基酸序列表的表述標(biāo)準(zhǔn)》，這就是WIPO ST.25。然后，國(guó)知局于2001年發(fā)布了ZC_0003-2001《核苷酸和/或氨基酸序列表和序列表電子文件標(biāo)準(zhǔn)》。其結(jié)合我國(guó)的一些國(guó)情對(duì)WIPO ST.25進(jìn)行了一些適當(dāng)?shù)男薷摹?001年11月，國(guó)知局公布ZC_0003-2001于2001年11月1日起，正式實(shí)施，一直沿用至今。但是，隨著時(shí)代的發(fā)展和進(jìn)步，ST.25逐漸暴露出起諸多弊端，特別是電子形式的標(biāo)準(zhǔn)化的深入，ST.25很難用于數(shù)據(jù)交換和自動(dòng)驗(yàn)證匹配。

因此，出于對(duì)電子形式的需要，以及對(duì)序列精確描述和檢索的需要，EPO于2010年向WIPO標(biāo)準(zhǔn)委員會(huì)提出了建立一個(gè)基于XML格式的生物序列標(biāo)準(zhǔn)ST.26。其目的在于統(tǒng)一全球的標(biāo)準(zhǔn)，使得原本25中模糊不清的規(guī)則得到統(tǒng)一，同時(shí)能夠提高電子形式的驗(yàn)證匹配和檢索，最后還能提高序列描述的精確程度。該標(biāo)準(zhǔn)于2010年10月開始由EPO負(fù)責(zé)牽頭起草，2016年3月正式審議通過。這就是WIPO ST.26標(biāo)準(zhǔn)的由來。

國(guó)知局于2022年6月10日發(fā)布第四五八號(hào)公告，宣布從2022年7月1日起，向國(guó)知局提交的國(guó)家專利申請(qǐng)和PCT國(guó)際申請(qǐng)，包含于序列表的，該序列表電子文件應(yīng)符合WIPO ST.26標(biāo)準(zhǔn)要求。因此，距今為止，該標(biāo)準(zhǔn)已經(jīng)實(shí)行了一個(gè)月左右了，大家也都是處于摸著石頭過河的階段，歡迎各位同行共同討論遇到的問題和解決方法。

二、WIPO Sequence軟件的簡(jiǎn)介

與WIPO ST.26標(biāo)準(zhǔn)同步發(fā)布的，也就是一款全新的軟件WIPO Sequence。這款軟件據(jù)稱由多國(guó)共同開發(fā)，因此，基本上各個(gè)國(guó)家不會(huì)在發(fā)布類似之前的PatentIn 3.5或者SIPO Sequence，以后都會(huì)統(tǒng)一使用WIPO Sequence，換句話說，這次發(fā)布的WIPO Sequence將會(huì)成為生物領(lǐng)域?qū)＠韼熞院箝L(zhǎng)久打交道的工具。說實(shí)話，軟件穩(wěn)定性不佳，筆者在寫這篇文章的時(shí)候，頻繁出現(xiàn)項(xiàng)目不能加載的情況：

有些時(shí)候重啟電腦可以解決，有些時(shí)候重啟電腦仍然無(wú)法決絕。至今未能找到錯(cuò)誤原因。

進(jìn)入正題，首先，這款軟件不是PatentIn，是有中文的，但是很多小伙伴卻發(fā)現(xiàn)每次進(jìn)去了之后都是默認(rèn)為英文，然后都要手動(dòng)的將它調(diào)成中文，筆者也曾經(jīng)很苦惱這個(gè)事情。但實(shí)際上它是可以設(shè)置的。咱們首先打開WIPO Sequence，會(huì)看到如下的標(biāo)簽欄：

其中，有一個(gè)優(yōu)選項(xiàng)，點(diǎn)開它，會(huì)跳轉(zhuǎn)到下面這一個(gè)頁(yè)面：

點(diǎn)擊旁邊筆型圖案就可以進(jìn)行修改啦，將工具界面默認(rèn)語(yǔ)言修改為中文，這樣每次打開之后都是中文了，再也不需要將其手動(dòng)從英文調(diào)成中文。

接下來，簡(jiǎn)單介紹一下上面標(biāo)簽欄的各個(gè)標(biāo)簽：

第一個(gè)就是“項(xiàng)目”，也就是我們每一件申請(qǐng)需要制作序列表的地方，都在項(xiàng)目這一欄中完成。

第二個(gè)是“個(gè)人和組織”，可以把它理解成專屬于代理師自己的整理庫(kù)，可以把自己經(jīng)常服務(wù)的申請(qǐng)人和發(fā)明人都增加進(jìn)去，這樣每次只需要勾選不需要重新輸入一遍了。

右上角有一個(gè)“創(chuàng)建新個(gè)人或組織”，點(diǎn)開之后，就可以填寫名稱、語(yǔ)言，和拉丁名稱。名稱正常填寫，語(yǔ)言根據(jù)需要進(jìn)行選擇，國(guó)內(nèi)一般選擇中文。

注意雖然此處拉丁名稱沒有標(biāo)星號(hào)，沒填寫也可以保存。但實(shí)際上，在序列表制作過程中是必須的，不然無(wú)法保存申請(qǐng)人。因此，建議此處可以寫申請(qǐng)人和發(fā)明人的英文名，沒有英文名可以寫拼音。

第三個(gè)是“生物體”，跟之前的所有軟件一樣，WIPO Sequence也是可以自主添加生物體的，而且在該處添加的生物體，會(huì)自動(dòng)出現(xiàn)在往后所有項(xiàng)目中Organism中。

所以，其實(shí)關(guān)于在WIPO Sequence中爭(zhēng)議頗多的“Artificial Sequence”這一選項(xiàng)的消失，很多同行建議用選項(xiàng)中存在的“Synthetic Construct”，即人工構(gòu)建體替代。筆者卻認(rèn)為，可以自主添加Artificial Sequence，然后其在以后的項(xiàng)目中均可以選擇，也不會(huì)報(bào)錯(cuò)。而“Synthetic Construct”，即人工構(gòu)建體，筆者的理解其更多是偏向于載體之類的，而常見的核酸引物和探針其實(shí)并不屬于人工構(gòu)建體。

第四個(gè)是“幫助”，在該標(biāo)簽里面會(huì)獲得一些其余的資料，包括軟件的操作手冊(cè)，標(biāo)準(zhǔn)ST.26的介紹。前者是有中文的，后者并沒有中文。這個(gè)很容易就能在WIPO的官網(wǎng)上找到。

三、序列制作簡(jiǎn)介

接下來，筆者簡(jiǎn)單的對(duì)序列表的制作進(jìn)行介紹。當(dāng)然一些簡(jiǎn)單的事項(xiàng)就不贅述了，主要是對(duì)一些易錯(cuò)項(xiàng)和少見情況進(jìn)行簡(jiǎn)介。當(dāng)然，筆者也處于摸索之中，難免會(huì)出現(xiàn)問題和錯(cuò)誤，請(qǐng)各位同行諒解。

首先是申請(qǐng)確定，基本上咱們面臨的情況都是沒有申請(qǐng)?zhí)柕臅r(shí)候制作的，所以申請(qǐng)人檔案名是必填的，此處可以填一些申請(qǐng)人或代理師自己的案號(hào)，檔案名也會(huì)體現(xiàn)在項(xiàng)目欄中。

至于如果有申請(qǐng)?zhí)?，那就勾選分配申請(qǐng)?zhí)柡螅缓筇顚憣?duì)應(yīng)的號(hào)碼和日期就行了。

接下來是申請(qǐng)人和發(fā)明人，如果如筆者所說創(chuàng)建了自己的發(fā)明人，則可以選擇現(xiàn)有發(fā)明人并在下拉菜單中進(jìn)行選擇。

但是需要提醒的是，如果只操作到此處，在最后的驗(yàn)證過程中會(huì)報(bào)錯(cuò)，在保存了發(fā)明人之后，需要代理師手動(dòng)回去選擇修改，將右下角的“標(biāo)記為主要”打勾并保存。因?yàn)?，ST.26只允許出現(xiàn)一個(gè)申請(qǐng)人，所以，需要將第一申請(qǐng)人標(biāo)記為主要，在最后的格式中也只會(huì)出現(xiàn)第一申請(qǐng)人。

再次是發(fā)明名稱，此處并沒有過多的注意事項(xiàng)，填寫對(duì)應(yīng)的發(fā)明名稱和語(yǔ)言即可。

最后則是重頭戲，序列。由于ST.26對(duì)于序列的各種特征規(guī)定的非常嚴(yán)格，所以在日常的制作中，代理師們需要根據(jù)序列的具體信息添加特征。

點(diǎn)擊創(chuàng)建新序列，則會(huì)出現(xiàn)如下方框：

序列名稱、分子類型、殘基大體上都跟之前使用PatentIn差不多，此處的生物體名稱，如果咱們自主創(chuàng)建了人工序列，則此處下拉菜單中就會(huì)有“Artificial sequence”這一選項(xiàng)，是可以進(jìn)行選擇的。

需要提醒的是，殘基，也就是輸入序列的地方，不能再像之前使用ST.25一樣可以隨意輸入各種字符了，否則會(huì)出現(xiàn)如下提示：

 現(xiàn)在核苷酸能使用的字符如下所示：

氨基酸能使用的字符如下所示：

總的來說，除開上述字符，核苷酸一律用n，氨基酸一律用X代替。然后再后續(xù)特征中選擇添加功能，并根據(jù)具體情況進(jìn)行描述。

例如，我們需要?jiǎng)?chuàng)建一段核苷酸序列atciiiatgg ggggg那么，我們輸入的應(yīng)該是atcnnnatggggggg，然后創(chuàng)建序列，并在如下圖所示中選擇添加功能：

選擇添加功能后將會(huì)出現(xiàn)如下選項(xiàng)：

我們?cè)谔卣麈I的下拉菜單中根據(jù)需要選擇modified base，然后再特征位置標(biāo)注4..7，這樣的意思是第4位到第7位為修飾堿基。特征鍵下拉菜單中有多種選項(xiàng)可以選擇，代理師可以根據(jù)序列具體序列信息進(jìn)行選擇。而位置的表述在ST.26中也有明確描述，如下所示：

根據(jù)位置關(guān)系自行選擇輸入模式即可。

在位置和特征鍵均描述完之后，則會(huì)出現(xiàn)如下所示的限定符值選擇：

在限定符值的下拉菜單中選擇i，即可，點(diǎn)擊創(chuàng)建特征，就生成了我們想要?jiǎng)?chuàng)建的序列。

這樣一個(gè)序列基本上就創(chuàng)建好了。需要提醒的是，如果在限定符值的下拉菜單中并未找到我們想要的類型，則可以選擇OTHER，并在再次彈出的note中，繼續(xù)填寫限定符值，如下所示：

但是，筆者卻至今卡在此處，不知道如何解決該問題。如果是自己自定義的限定符值，按照它的操作，均填寫完畢后會(huì)報(bào)錯(cuò)，如下所示：

該錯(cuò)誤描述的“特征位置”暫時(shí)并不清楚其代表的含義。筆者有同事讓我在項(xiàng)目再開始的設(shè)置中設(shè)置非英文自由文本語(yǔ)言代碼，但仍然未解決該問題。

以上就是創(chuàng)建一個(gè)序列，特別是含有少見序列信息的序列的方法。當(dāng)然，由于時(shí)間較短，筆者也只是簡(jiǎn)單的介紹一些知識(shí)，遇到更為特殊信息的序列，其處理方法肯定更為復(fù)雜和少見，但是筆者今天所介紹的方法，應(yīng)該足以應(yīng)付95%以上的序列創(chuàng)建。

除此之外，還有一些注意事項(xiàng)需要各位關(guān)注：

1、雖然國(guó)知局規(guī)定了在以后的申請(qǐng)中，均只需要遞交XML格式的序列表，而不需要TXT格式的序列表。但是國(guó)知局同樣注明了為了方便計(jì)算費(fèi)用，在遞交時(shí)，仍然需要遞交PDF版本的序列表，而把XML格式轉(zhuǎn)化成PDF格式是會(huì)出現(xiàn)亂碼而且不太美觀，但是WIPO Sequence自帶打印功能，就在項(xiàng)目名稱旁邊有一個(gè)打印按鈕，如下圖所示，即可完成打印，截止到目前為止，筆者遞交的國(guó)內(nèi)申請(qǐng)，PDF均是遞交的通過這一途徑打印出來的PDF。

2、在驗(yàn)證過程中，出現(xiàn)警告可以無(wú)需理會(huì)，仍能生成序列表。但是如果一旦出現(xiàn)錯(cuò)誤，則無(wú)法生成序列表，必須要把錯(cuò)誤消除，才能生成序列表。

3、新版本序列表中只能出現(xiàn)一個(gè)申請(qǐng)人，因此，煩請(qǐng)?jiān)谔顚懮暾?qǐng)人材料時(shí)，將第一申請(qǐng)人勾選為主要。

（原標(biāo)題：關(guān)于WIPO ST.26 序列表制作的一些tips）

來源：IPRdaily中文網(wǎng)（iprdaily.cn）

作者：鄧旭 北京派特恩知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司

編輯：IPRdaily王穎          校對(duì)：IPRdaily縱橫君

注：原文鏈接： 關(guān)于WIPO ST.26 序列表制作的一些tips （點(diǎn)擊標(biāo)題查看原文）

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