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WIPO Sequence 生物醫(yī)藥專利申請(qǐng)如何批量導(dǎo)入序列?

行業(yè)
納暮2年前
WIPO Sequence 生物醫(yī)藥專利申請(qǐng)如何批量導(dǎo)入序列?

#本文僅代表作者觀點(diǎn),不代表IPRdaily立場(chǎng),未經(jīng)作者許可,禁止轉(zhuǎn)載#


“一招教您WIPO Sequence 批量導(dǎo)入序列?!?/strong>


來(lái)源:IPRdaily中文網(wǎng)(iprdaily.cn)

作者:周妍卓 覃晴 * 上海漢盛律師事務(wù)所


1998年11月,WIPO出臺(tái)了《專利申請(qǐng)中核苷酸和氨基酸序列表的表述標(biāo)準(zhǔn)》(WIPO ST.25標(biāo)準(zhǔn)),為統(tǒng)一全球的標(biāo)準(zhǔn)并提高電子形式的驗(yàn)證匹配和提供更精確的生物序列信息,WIPO標(biāo)準(zhǔn)委員會(huì)制定了WIPO ST.26標(biāo)準(zhǔn),并要求于2022年1月1日起,WIPO所有成員國(guó)在國(guó)際、國(guó)家或者地區(qū)層面上提交的生物序列文件,都要符合WIPO ST.26標(biāo)準(zhǔn)。與WIPO ST.26標(biāo)準(zhǔn)同步發(fā)布的,還有WIPO提供的名為“WIPO Sequence”的桌面工具,該工具的作用是編制符合WIPO ST.26標(biāo)準(zhǔn)的氨基酸和核苷酸序列表。我國(guó)國(guó)知局也宣布從2022年7月1日起,向國(guó)知局提交的國(guó)家專利申請(qǐng)和PCT國(guó)際申請(qǐng)中包含有序列表的,該序列表電子文件應(yīng)符合WIPO ST.26標(biāo)準(zhǔn)要求,也就是說(shuō)WIPO Sequence已經(jīng)成為生物領(lǐng)域?qū)@韼煴夭豢缮俚墓ぞ摺?/p>


但是WIPO Sequence面世時(shí)間較短,用戶對(duì)其功能的發(fā)掘程度較少,官方用戶手冊(cè)中的記錄也比較簡(jiǎn)單,因此,大部分申請(qǐng)人只了解簡(jiǎn)單的創(chuàng)建方法,在面對(duì)一些需要進(jìn)行批量處理的操作時(shí)不知道如何快捷處理。例如,生物醫(yī)藥專利申請(qǐng)中,有時(shí)需要處理上百條序列,面對(duì)密密麻麻的序列表,代理人常常痛苦不已,如果在WIPO SEQUENCE中使用常用的單獨(dú)創(chuàng)建方式,一個(gè)一個(gè)地去創(chuàng)建序列,處理上百條序列時(shí)不僅耗費(fèi)時(shí)間,還易出錯(cuò)。


那么,有什么批量處理的方法可以讓我們的代理工作事半功倍呢?


筆者在查閱了官方用戶手冊(cè)(https://www.wipo.int/export/sites/www/standards/en/sequence/wipo-sequence-manual.pdf)及多次嘗試后,總結(jié)出了一個(gè)批量導(dǎo)入序列的方法。


第一步,先按照WIPO SEQUENCE官方的ST.25格式(圖1)對(duì)序列表進(jìn)行修改:


WIPO Sequence 生物醫(yī)藥專利申請(qǐng)如何批量導(dǎo)入序列?

圖1(來(lái)源于用戶手冊(cè))


上面的官方說(shuō)明,簡(jiǎn)單翻譯一下就是要按<序列名稱; 序列類型; 生物體>的順序?qū)γ總€(gè)序列進(jìn)行注釋,這里的序列名稱、序列類型、生物體參照我們單獨(dú)創(chuàng)建序列時(shí)WIPO SEQUENCE官方提供的選項(xiàng)進(jìn)行撰寫(xiě)即可。例如,序列類型有DNA、RNA和AA,然后在注釋下面另起一行,輸入序列(友情提示:按照ST.26的要求,RNA里的u需要替換為t)。對(duì)所有的序列都按上述格式進(jìn)行修改后,將文本保存為txt格式就可以進(jìn)行下一步操作。按照一般軟件的讀取習(xí)慣,這里建議所有的標(biāo)點(diǎn)符號(hào)都用英文版本,分號(hào)后加上空格。筆者沒(méi)有嘗試過(guò)用中文標(biāo)點(diǎn)符號(hào),不確定是否會(huì)影響上傳。


第二步,在WIPO SEQUENCE中創(chuàng)建項(xiàng)目,并依據(jù)個(gè)人需求進(jìn)行信息填寫(xiě),這一步相信大家都會(huì)做,網(wǎng)上也有不少教程就不在此進(jìn)行贅述。


第三步,進(jìn)入我們已經(jīng)建好的項(xiàng)目中,選擇導(dǎo)入序列后上傳文件即可。


下面簡(jiǎn)單舉例說(shuō)明:


首先,將序列表修改為如下格式后,保存為txt格式:


<001; RNA; synthetic construct>
acagtgccatgagcatga
<002; DNA; synthetic construct>
accgctggcctctgtgca
<005; AA; synthetic construct>
NAYVGFSANVRSPFEYPQYYLAECNLEGFTLGGPPPEIAVTIPMIIIFFCYGQLVFTVCKTVASTLYTTVQKSMLAAWEKVIAAFLICCWVPVYAQASVAFYIFTHQGSNFGPIFMTIPAFVVTCKSIYNPVMAACV


然后,在創(chuàng)建好的項(xiàng)目中選擇導(dǎo)入序列,隨后上傳文件(圖2~3),是否勾選“輸入待導(dǎo)入的序列”并不會(huì)影響結(jié)果,不勾選時(shí)只是不會(huì)顯示序列號(hào)等內(nèi)容(圖2~4)。導(dǎo)入序列之后,就可以按通常做法進(jìn)行編輯、打印、生成序列表等常規(guī)操作,最終生成的序列表如圖5,符合國(guó)知局要求。


WIPO Sequence 生物醫(yī)藥專利申請(qǐng)如何批量導(dǎo)入序列?

圖2


WIPO Sequence 生物醫(yī)藥專利申請(qǐng)如何批量導(dǎo)入序列?

圖3

WIPO Sequence 生物醫(yī)藥專利申請(qǐng)如何批量導(dǎo)入序列?圖4

WIPO Sequence 生物醫(yī)藥專利申請(qǐng)如何批量導(dǎo)入序列?

WIPO Sequence 生物醫(yī)藥專利申請(qǐng)如何批量導(dǎo)入序列?

圖5


經(jīng)過(guò)對(duì)如何批量處理序列表這一問(wèn)題的探索,不難看出,WIPO官方提供的軟件功能較為齊全,用戶界面也簡(jiǎn)單明了,但用戶對(duì)其發(fā)掘程度較淺,還有很多功能待開(kāi)發(fā),期待有更多后來(lái)人把官方提供的各種用戶手冊(cè)最大程度地利用起來(lái),發(fā)掘更多的快捷操作,助力專利申請(qǐng)。


注:

*本文作者來(lái)自于駱順耀團(tuán)隊(duì)


(原標(biāo)題:WIPO Sequence 批量導(dǎo)入序列的方法)


來(lái)源:IPRdaily中文網(wǎng)(iprdaily.cn)

作者:周妍卓 覃晴 上海漢盛律師事務(wù)所

編輯:IPRdaily趙甄          校對(duì):IPRdaily縱橫君


注:原文鏈接WIPO Sequence 生物醫(yī)藥專利申請(qǐng)如何批量導(dǎo)入序列?點(diǎn)擊標(biāo)題查看原文)


WIPO Sequence 生物醫(yī)藥專利申請(qǐng)如何批量導(dǎo)入序列?

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(英文官網(wǎng):iprdaily.com  中文官網(wǎng):iprdaily.cn) 


本文來(lái)IPRdaily中文網(wǎng)(iprdaily.cn)并經(jīng)IPRdaily.cn中文網(wǎng)編輯。轉(zhuǎn)載此文章須經(jīng)權(quán)利人同意,并附上出處與作者信息。文章不代表IPRdaily.cn立場(chǎng),如若轉(zhuǎn)載,請(qǐng)注明出處:“http://islanderfriend.com”

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